Un collezionista di Pokèmon rari,LowrenceIII,cerca di catturare i tre uccelli leggendari,Zapdos,Articuno e Moltres. Se riuscisse nel suo intento,l’armonia e l’equilibrio della natura verrebbe turbata. Così la profezia dice che sarà il compito del Prescelto,in questo caso,di ristabilire l’equilibrio. Mentre Lowrence cattura i Pokèmon leggendari uno dopo l’altro,Ash sbarca su un isola chiamata Shamuthi. Vengono accolti dagli abitanti dell’isola, che, quando vedono Ash,iniziano a chiamarlo "il Prescelto". E’ proprio così:sarà compito di Ash ristabilire l’equilibrio. Quindi liberano Moltres,Zapdos e Articuno dalle grinfie di Lowrence. Ma ,una volta tornati in libertà,gli uccelli leggendari iniziano a litigare tra loro! Così appare Lugia in aiuto di Ash,che riesce a contrastare gli attacchi dei Pokèmon,ma quando arriva un attacco di gruppo,Lugia non ce la fa più e sviene. Ash deve riportare le sfere del ghiaccio,fuoco e fulmine nei rispettivi tempietti per ristabilire la pace:così con l’aiuto (inaspettato) del Team Racket,riescono a portare a termine la missione. Ma anche se i tre uccelli leggendari si sono calmati,Lugia ha esaurito le forze per il combattimento precedente. Così Melody,una ragazza che aveva accolto Ash & Co. quando erano arrivati nell’isola, suona una canzone che fa tornare in forze Lugia. Così l’armonia e l’equilibrio delle forze della natura viene ristabilito,e Lowrence viene sconfitto.

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